Метод может быть противопоказан при кератоконусе и других эктазиях роговицы, недостаточной толщине роговицы, нестабильной рефракции, выраженной сухости глаз и некоторых других заболеваниях.
Во время беременности и грудного вскармливания проведение операции обычно откладывают.
Перед вмешательством обязательна комплексная диагностика. Если Femto LASIK не подходит, офтальмохирург может предложить другой метод коррекции зрения.